菌树 FungTree Logo 菌树 FungTreeFung · Tree
核心优势 工作流 桌面端 安装说明 标本画廊 登录
内部测试版开放下载 · Windows & Android

探索自然每一种
珍稀菌物 大型真菌标本 · 分子系统发育 · 一体化管理软件

从 AB1 色谱到物种鉴定只需一键。菌树 FungTree 集标本采集、序列分析、BLAST 鉴定、系统发育重建与团队协作于一体——自研引擎加国际标准,让科研全链路在一台电脑上闭环。

2种模式
可选择单机、网络模式
4
国际标准引擎
3
自研科学引擎
全链路
采集到发表闭环
Core Pillars

为什么选择 菌树

三大自研引擎叠加国际金标工具,把传统数小时的真菌分子鉴定流程,压缩到一杯咖啡的时间。

01 / 建树

永远给你一棵树

独创三级 fallback 建树链:金标 IQ-TREE2 优先,失败自动切换自研 PhyloFungi 最大似然,再降级邻接法 NJ。无论数据如何,始终产出一棵可解读的系统发育树。

IQ-TREE2PhyloFungi MLNJBootstrap
02 / 鉴定

BLAST 双引擎检索

本地 BLAST+ 数据库支持离线检索,未命中时可转 NCBI 在线比对;结果返回相似度、覆盖度与物种分类信息,供研究者综合判断,不替代人工复核。

BLAST+ 本地NCBI 在线Taxonomy
03 / 比对

ITS 感知多序列比对

自研 fungaligner 引擎针对真菌 ITS 区优化,比通用比对工具更懂真菌的序列特征;搭配 smarttrim 智能修剪,自动识别低质量区域、去引物、去噪音。

fungalignersmarttrimITS 提取
04 / 管线

一键全自动分析

导入 AB1 文件,一条管线自动完成:质量评估 → 引物检测 → 重峰识别 → 智能修剪 → BLAST 鉴定。传统需要多软件、数小时的工作,15S/条到无限批量

AB1 读取峰检测去卷积质控
Workflow

覆盖菌物研究完整工作流

从野外采集到分子鉴定,从数据管理到论文发表——一朵蘑菇的科研生命周期,一个软件全搞定。

野外采集

手机拍照自动提取 EXIF、GPS 与海拔,支持离线录入,回到网络环境一键同步至桌面端。

AB1 色谱分析

读取 Sanger 测序 AB1 文件,峰检测、去卷积、混合峰识别、共识序列拼接与质量评估。

BLAST 鉴定

本地 + NCBI 双引擎检索,物种 taxonomy 自动归属,提供相似度与覆盖度等参考指标。

系统发育建树

三级 fallback 始终产出结果,支持 Bootstrap 自展检验,生成可发表级系统发育树图。

调查报告

根据您的标本数据自动分析数据、为您提供一份标准格式的大型真菌调查报告。

Windows Desktop · v2.0.0

桌面端完整分析套件

Python + FastAPI + React 单机架构,本地 58000 端口运行,数据不出本机。内置四大国际标准工具链与三大自研引擎,离线可用。

  • 标本档案管理
    卡片式标本库、图片/EXIF/GPS 关联、多维度筛选与批量操作
  • AB1 色谱图交互浏览
    峰图缩放、引物标注、重峰高亮、质量曲线一图统览
  • 多序列比对与建树可视化
    MAFFT / 自研比对,phylocanvas 交互式系统发育树渲染
  • 地理热力图与多样性统计
    leaflet 地图热力、采集时间线、物种多样性多维分析
BLAST+ MAFFT IQ-TREE2 MrBayes PhyloFungi fungaligner smarttrim
Download

下载测试版

当前为内部测试版本,可供体验与反馈。安装前请阅读下方安装说明。

菌树 FungTree 图标

Android 测试包

菌树联网版 App · v1.8.2
版本 1.8.2 14.6 MB Android 6.0+ ARM64 / ARMv7

适合野外采集、标本录入与团队协作。此包为联网版,使用账号与服务器同步数据,已使用正式发布证书签名。

Windows 桌面 7 天试用包

FungTree · 2026-09-21
构建 2026-09-21 ZIP 187.0 MB Windows 10/11 x64 解压即用

包含 AB1 分析及 BLAST、MAFFT、IQ-TREE2 / MrBayes 本地工具。首次联网启用后可试用 7 天,到期需激活后继续使用。此包尚未完成 Windows 代码签名。

Installation

安装说明

按顺序操作即可。如遇问题,可在测试反馈群联系。

Android 安装

  1. 点击下载 mushroom-release-1.8.2.apk 到手机或电脑。
  2. 在手机「设置 → 安全」中开启允许安装未知来源应用。
  3. 找到下载的 APK 文件,点击安装。
  4. 打开应用并登录账号,体验标本采集与录入。
  5. 使用同步与团队功能时,请保持网络连接。本下载包为联网版 App。

Windows 安装

  1. 点击上方下载 Windows ZIP,将压缩包保存到本地。
  2. 右键解压到任意目录(建议路径不含中文与空格)。
  3. 进入解压后的软件文件夹,先阅读 使用说明.txt,保留其中所有配套文件。
  4. 双击运行 菌树FungTree.exe,首次启动请等待数据库加载。
  5. 首次使用请联网启用7 天试用,到期后需激活。重新安装不会重置同一机器的试用截止时间。